Output descriptions

./
├── demo_report.html                        1 
├── demo_summary.csv                        2
├── demo_summary.json                    
├── step1                                
│   └──demo_2.fq.gz                      
├── step2                                
│   ├── featureCounts                    
│   │   └── demo_SortedByName.bam        
│   └── STAR                             
│       ├── demo_Log.final.out           
│       └── demo_SortedByCoordinate.bam  
├── step3
│   ├── filtered_feature_bc_matrix          3
│   └── raw_feature_bc_matrix            
└──step4                                 
    ├── FeatureScatter.png               
    ├── FindAllMarkers.xls               
    ├── mito_quantile.xls                
    ├── nCount_quantile.xls              
    ├── nFeature_quantile.xls            
    ├── resolution.xls                   
    ├── top10_heatmap.png                
    ├── tsne.png                         
    ├── tsne_umi.png                     
    ├── tsne_umi.xls                     
    ├── umap.png                         
    └── VlnPlot.png                      

1. Final report in html

2. Quality control information in csv

3. Filtered feature-barcode matrix