结果文件说明

以下是输出目录结构：每一行代表一个文件或文件夹，用 "├──" 表示，数字表示三个重要的输出文件。

./
├── demo_report.html                          1
├── demo_summary.csv                          2
├── demo_summary.json                    
├── step1                                
│   └──demo_2.fq.gz                      
├── step2                               
│   ├── featureCounts                   
│   │   └── demo_SortedByName.bam      
│   └── STAR                            
│       ├── demo_Log.final.out          
│       └── demo_SortedByCoordinate.bam  
├── step3
│   ├── filtered_feature_bc_matrix            3
│   └── raw_feature_bc_matrix          
└──step4                                
    ├── FeatureScatter.png              
    ├── FindAllMarkers.xls               
    ├── mito_quantile.xls               
    ├── nCount_quantile.xls             
    ├── nFeature_quantile.xls           
    ├── resolution.xls                   
    ├── top10_heatmap.png               
    ├── tsne.png                         
    ├── tsne_umi.png                    
    ├── tsne_umi.xls                     
    ├── umap.png                        
    └── VlnPlot.png                      

1. 样本的html报告

2. 样本的csv格式质控信息

3. 算法判定是细胞的稀疏矩阵