SeekSoulTools
SeekSoulTools 是寻因生物开发的一套处理单细胞转录组数据的软件,目前该软件包含两个模块:
rna模块:用于识别细胞标签barcode,比对定量,得到可用于下游分析的细胞表达矩阵,之后进行细胞聚类和差异分析,该模块不仅支持SeekOne®系列试剂盒产出数据,还可通过对barcode的描述,支持多种自定义设计结构;
fast模块:该模块专门针对SeekOne® DD单细胞全序列转录组试剂盒和SeekOne® DD FFPE样本单细胞转录组试剂盒产出的数据,用于对数据进行barcode提取,双端reads比对,定量,以及全序列数据特有的指标统计;
vdj模块:该模块用于专门针对SeekOne® DD单细胞免疫分析试剂盒产出的数据,用于组装、过滤和注释免疫受体;
utils模块:该模块包含其他小工具。