seeksoultools
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使用教程
rna模块
fast模块
vdj模块
数据准备
运行示例
构建ref文件示例
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multivdj模块
utils模块
常见问题
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seeksoultools
使用教程
vdj模块
vdj模块
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运行
运行示例
软件参数说明
构建ref文件示例
方式一:可利用trust4软件,获取IMGT数据库并构建所需ref。
方式二:如果genes.gtf文件中基因名称不包含所需的BCR/TCR 基因名称的话,可单独配置:
准备leader文件
写入cfg文件
结果文件说明
处理过程
barcode/UMI提取
结构设计和描述
数据流程
Barcode识别和矫正
VDJ基因比例统计
序列组装
VDJ注释
clonotype计算
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