数据准备

测试数据下载

测试数据 - md5: 6601c8f3c4c827d2a30fcb5c6d0dee7c（物种：人）

wget下载方式

wget -c -O demo3k.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/demo3k.tar"
# decompress
tar xf demo3k.tar

curl下载方式

curl -C - -o demo3k.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/demo3k.tar"
# decompress
tar xf demo3k.tar

参考基因组下载和构建

Download-human-reference-GRCh38 - md5: 5473213ae62ebf35326a85c8fba6cc42

wget下载方式

mkdir -p /demo/refdata/
cd /demo/refdata/
wget -c -O GRCh38.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/GRCh38.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf GRCh38.tar.gz

curl下载方式

mkdir -p /demo/refdata/
cd /demo/refdata/
curl -C - -o GRCh38.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/GRCh38.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf GRCh38.tar.gz

参考基因组的构建可以参考如何构建参考基因组？