addtag
对bam进行修改,添加barcode和umi标签。
运行示例
为分析设置必要的配置文件,包括样本的bam文件和step3目录下的umi.xls文件。使用以下命令运行SeekSoulTools:
seeksoultools utils addtag \
--inbam step2/featureCounts/Samplename_SortedByName.bam \
--umifile step3/umi.xls \
--outbam Samplename_addtag.bam
软件参数说明
参数 |
参数说明 |
---|---|
–inbam |
输入的bam,step2 featureCount目录下的bam文件。 |
–outbam |
addtag之后的bam文件名称 |
–umifile |
输入的umi文件,seeksoultools输出目录step3的umi.xls文件 |